甜瓜嫁接苗适宜采用低畦培育。床坑深10厘米左右，床沿土培紧踩实，床坑底整平踩紧。
嫁接苗边放入育苗床，边支小拱棚覆盖保护。放满一个育苗床后，用小拱棚将苗床严密覆盖，保温保湿。
(1)温度管理嫁接后第一周内的温度管理最为关键，此期的适宜温度为25-32℃，夜间最低温度不低于15℃。嫁接苗成活后，白天温度保持25-30℃，夜间温度保持巧℃左右。早春栽培用苗，定植前一周要逐渐降低温度，对瓜苗进行耐寒性锻炼，此期的白天温度可降低到20-25℃，夜间温度可降低到8℃左右。
(2)湿度管理嫁接后头三天要保持苗床内较高的空气湿度，要求不低于90%。从第四天开始对苗床进行通风，降低空气湿度，避免湿度长时间过高引起瓜苗腐烂。初期通风的时间要短，通风口也要小，待瓜苗适应后再加大通风量。适宜的通风时间和通风口大小是通风后瓜苗不发生萎蔫。
苗床开始大通风后，苗土失水加快，容易变干燥，要勤浇水，每次浇水量要足，要把育苗钵土浇透。
(3)光照管理嫁接后头三天如果为晴天，要用草苫对苗床进行遮荫，防止嫁接苗受强光照射后发生萎蔫。从第四天开始，上午推迟遮光时间，下午提前揭苫的时间，逐日缩短遮光的时间。嫁接苗完全成活后，去掉草苫，对嫁接苗进行自然光照管理。
甜瓜较喜光，育苗期间如果遇到连阴天，要用日光灯对苗床进行人工补光。
(4)其他管理
A.分床管理：通常于嫁接后第十天左右当嫁接苗完全成活后，根据苗子的长相不同，将嫁接苗按成活质量好、成活质量差和没成活进行分类。把成活质量好的苗集中于一起，在培育壮苗的环境下进行管理，把成活质量差的苗也集中于一起，继续给予成活期间的条件进行培育。把没成活的苗从苗床中剔出扔掉。
B.砧木苗抹茬：砧木苗上长出的枝蔓要随长出随抹掉，防止枝蔓与甜瓜苗穗争夺营养而抑制甜瓜苗穗的生长。
C.甜瓜苗抹根：甜瓜苗茎上长出的不定根要随长出随抹掉，避免不定根扎入地里后，与砧木根系争夺营养而抑制砧木根系的生长。
